东北大学井上明久校长与东南大学易红校长，于2009年6月29日签署了两校间学术交流协定。东北大学经济学研究科、生命科学研究科、工学研究科分别与东南大学经济管理学院、公共卫生学院、能源与环境学院之间已有的教育研究交流事业进入了一个新的起点，并计划进一步推进和扩展两校间的学术交流。
2008年10月，以生命科学研究科中静透教授为首的东北大学访问团前往东南大学，与东南大学浦跃朴副校长等人进行了会谈。会谈上中静教授就08年度我校开始实施的全球COE项目—-“面对环境突变的生态系适应的教育研究”进行了说明，两校代表就此项目的两校合作意图上达成共识。出席此次会谈的还有东北大学生命科学研究科河田雅教授、占部城太郎教授、经济学研究科林山泰久教授、工学研究科西村修教授；东南大学能源与环境学院金保升院长、李先宁教授、陈永平教授、公众卫生学院尹立红副院长、经济管理学院邱斌教授。
本年度我校将接受来自东南大学的学术振兴会外籍特别研究员、中国政府派遣研究员以及博士课程留学生，积极推进教育研究的交流。此外，东南大学易红校长一行预计于今年10月份访问东北大学。